Dev0.5.0

增加测试文件及测试样例
修改部分变量命名

* 1. CRF增加支持bmeso类型的tag 2. vocabulary中增加注释

* BucketSampler增加一条错误检测

* 1.修改ClipGradientCallback的bug；删除LRSchedulerCallback中的print，之后应该传入pbar进行打印;2.增加MLP注释

* update MLP module

* 增加metric注释；修改trainer save过程中的bug

* Update README.md

fix tutorial link

* Add ENAS (Efficient Neural Architecture Search)

* add ignore_type in DataSet.add_field

* * AutoPadder will not pad when dtype is None
* add ignore_type in DataSet.apply

* 修复fieldarray中padder潜在bug

* 修复crf中typo; 以及可能导致数值不稳定的地方

* 修复CRF中可能存在的bug

* change two default init arguments of Trainer into None

* Changes to Callbacks:
* 给callback添加给定几个只读属性
* 通过manager设置这些属性
* 代码优化，减轻@transfer的负担

* * 将enas相关代码放到automl目录下
* 修复fast_param_mapping的一个bug
* Trainer添加自动创建save目录
* Vocabulary的打印，显示内容

* * 给vocabulary添加遍历方法

* 修复CRF为负数的bug

* add SQuAD metric

* add sigmoid activate function in MLP

* - add star transformer model
- add ConllLoader, for all kinds of conll-format files
- add JsonLoader, for json-format files
- add SSTLoader, for SST-2 & SST-5
- change Callback interface
- fix batch multi-process when killed
- add README to list models and their performance

* - fix test

* - fix callback & tests

* - update README

* 修改部分bug；调整callback

* 准备发布0.4.0版本“

* update readme

* support parallel loss

* 防止多卡的情况导致无法正确计算loss“

* update advance_tutorial jupyter notebook

* 1. 在embedding_loader中增加新的读取函数load_with_vocab(), load_without_vocab, 比之前的函数改变主要在(1)不再需要传入embed_dim(2)自动判断当前是word2vec还是glove.
2. vocabulary增加from_dataset(), index_dataset()函数。避免需要多行写index dataset的问题。
3. 在utils中新增一个cache_result()修饰器，用于cache函数的返回值。
4. callback中新增update_every属性

* 1.DataSet.apply()报错时提供错误的index
2.Vocabulary.from_dataset(), index_dataset()提供报错时的vocab顺序
3.embedloader在embed读取时遇到不规则的数据跳过这一行.

* update attention

* doc tools

* fix some doc errors

* 修改为中文注释，增加viterbi解码方法

* 样例版本

* - add pad sequence for lstm
- add csv, conll, json filereader
- update dataloader
- remove useless dataloader
- fix trainer loss print
- fix tests

* - fix test_tutorial

* 注释增加

* 测试文档

* 本地暂存

* 本地暂存

* 修改文档的顺序

* - add document

* 本地暂存

* update pooling

* update bert

* update documents in MLP

* update documents in snli

* combine self attention module to attention.py

* update documents on losses.py

* 对DataSet的文档进行更新

* update documents on metrics

* 1. 删除了LSTM中print的内容; 2. 将Trainer和Tester的use_cuda修改为了device; 3.补充Trainer的文档

* 增加对Trainer的注释

* 完善了trainer，callback等的文档; 修改了部分代码的命名以使得代码从文档中隐藏

* update char level encoder

* update documents on embedding.py

* - update doc

* 补充注释，并修改部分代码

* - update doc
- add get_embeddings

* 修改了文档配置项

* 修改embedding为init_embed初始化

* 1.增加对Trainer和Tester的多卡支持;

* - add test
- fix jsonloader

* 删除了注释教程

* 给 dataset 增加了get_field_names

* 修复bug

* - add Const
- fix bugs

* 修改部分注释

* - add model runner for easier test models
- add model tests

* 修改了 docs 的配置和架构

* 修改了核心部分的一大部分文档，TODO：
1. 完善 trainer 和 tester 部分的文档
2. 研究注释样例与测试

* core部分的注释基本检查完成

* 修改了 io 部分的注释

* 全部改为相对路径引用

* 全部改为相对路径引用

* small change

* 1. 从安装文件中删除api/automl的安装
2. metric中存在seq_len的bug
3. sampler中存在命名错误，已修改

* 修复 bug ：兼容 cpu 版本的 PyTorch
TODO：其它地方可能也存在类似的 bug

* 修改文档中的引用部分

* 把 tqdm.autonotebook 换成tqdm.auto

* - fix batch & vocab

* 上传了文档文件 *.rst

* 上传了文档文件和若干 TODO

* 讨论并整合了若干模块

* core部分的测试和一些小修改

* 删除了一些冗余文档

* update init files

* update const files

* update const files

* 增加cnn的测试

* fix a little bug

* - update attention
- fix tests

* 完善测试

* 完成快速入门教程

* 修改了sequence_modeling 命名为 sequence_labeling 的文档

* 重新 apidoc 解决改名的遗留问题

* 修改文档格式

* 统一不同位置的seq_len_to_mask, 现统一到core.utils.seq_len_to_mask

* 增加了一行提示

* 在文档中展示 dataset_loader

* 提示 Dataset.read_csv 会被 CSVLoader 替换

* 完成 Callback 和 Trainer 之间的文档

* index更新了部分

* 删除冗余的print

* 删除用于分词的metric，因为有可能引起错误

* 修改文档中的中文名称

* 完成了详细介绍文档

* tutorial 的 ipynb 文件

* 修改了一些介绍文档

* 修改了 models 和 modules 的主页介绍

* 加上了 titlesonly 这个设置

* 修改了模块文档展示的标题

* 修改了 core 和 io 的开篇介绍

* 修改了 modules 和 models 开篇介绍

* 使用 .. todo:: 隐藏了可能被抽到文档中的 TODO 注释

* 修改了一些注释

* delete an old metric in test

* 修改 tutorials 的测试文件

* 把暂不发布的功能移到 legacy 文件夹

* 删除了不能运行的测试

* 修改 callback 的测试文件

* 删除了过时的教程和测试文件

* cache_results 参数的修改

* 修改 io 的测试文件; 删除了一些过时的测试

* 修复bug

* 修复无法通过test_utils.py的测试

* 修复与pytorch1.1中的padsequence的兼容问题; 修改Trainer的pbar

* 1. 修复metric中的bug; 2.增加metric测试

* add model summary

* 增加别名

* 删除encoder中的嵌套层

* 修改了 core 部分 import 的顺序，__all__ 暴露的内容

* 修改了 models 部分 import 的顺序，__all__ 暴露的内容

* 修改了文件名

* 修改了 modules 模块的__all__ 和 import

* fix var runn

* 增加vocab的clear方法

* 一些符合 PEP8 的微调

* 更新了cache_results的例子

* 1. 对callback中indices潜在None作出提示;2.DataSet支持通过List进行index

* 修改了一个typo

* 修改了 README.md

* update documents on bert

* update documents on encoder/bert

* 增加一个fitlog callback，实现与fitlog实验记录

* typo

* - update dataset_loader

* 增加了到 fitlog 文档的链接。

* 增加了 DataSet Loader 的文档

* - add star-transformer reproduction

* 升级parser API和模型
* update docs: add new pages for tutorials
* upgrade CWS api download source
* add a new method for dataset field access
* add introduction for bert
* add more unit tests for api/processor
* remove unused test data. Add new test data.

* add DataSet.get_field(), to fetch a FieldArray based on its name
* remove old tutorials & add new tutorials

* 更新测试代码，跑通所有测试，覆盖率65%
* refine代码规范和某些注释
* fix tester self.use_cuda未赋值先使用的bug
* 添加tutorial样例数据——tutorial_sample_dataset.csv
* 【unsolved】embed_loader在计算np.cov时遇到segmentation fault

* 添加fast_load_embedding方法，用vocab的词索引pre-trained中的embedding
* 如果vocab有词没出现在pre-train中，从已有embedding中正态采样

Update embed_loader:
* add fast_load_embedding method, to index pre-trained embedding with words in Vocab
* If words in Vocab are not exist in pre-trained, sample them from normal distribution computed by current embeddings

- DataSet's __init__ takes a function as argument, rather than class object
- Preprocessor is about to remove. Don't use anymore.
- Remove cross_validate in trainer, because it is rarely used and wired
- Loader.load is expected to be a static method
- Delete sth. in other_modules.py
- Add more tests
- Delete extra sample data

2. changes of names:
  aggregation ----> aggregator
  interaction ----> interactor
  action.py ----> sampler.py
  BasePreprocess ---> Preprocessor
  BaseTester ----> Tester
  BaseTrainer ----> Trainer
3. add more code comments
4. fix bugs in predictor's data_forward
5. in sampler.py, remove Bachifier, fix some codes. but not test
6. remove unused codes in other_modules.py & utils.py
7. update fastnlp.py with new config file names and code comments
8. add data examples in data_for_tests/

- add Loss, Optimizer
- change Trainer & Tester initialization interface: two styles of definition provided
- handle Optimizer construction and loss function definition in a hard manner
- add argparse in task-specific scripts. (seq_labeling.py & text_classify.py)
- seq_labeling.py & text_classify.py work

- fastNLP interface for sequence labeling works
- fastNLP interface for text classification works

- rename "POSTrainer" to "SeqLabelTrainer"
- add text classification test data
- update make_batch in  Trainer and Tester

- [model] optimize cuda support in seq labeling model
- [test] add test data "pku" for chinese word seg
- test_tester.py and test_cws.py is OK to run!

- [tester][trainer] add cuda support
- [preprocess] fix label2index for padding label seq
- update README.md
- [test] add test_tester.py
- rename "action" to "core"

- [trainer]rename "batchify" to "make_batch" in trainer
- [trainer]pack (batch_x_pad, seq_len) into batch_x in make_batch for seq labeling, because seq length before pad is needed to make masks
- [trainer]unpack it in data_forward
- [model]shorten model definition
- [inference]build inference class. test_POS_pipeline.py is OK to infer
- [preprocessor]handle pickles in a nicer manner
- [FastNLP] add fastNLP.py as high-level API, not finished yet

optimize evaluation output in Trainer;
keep POS pipeline (loader + trainer + tester + saver) OK;
add codes borrowed from FudanParser.

- add people.txt in data_for_tests
- To do: incorrect CRF param in POS_pipeline