Browse Source

修改collator

tags/v1.0.0alpha
MorningForest 2 years ago
parent
commit
4e1b74c4cb
2 changed files with 8 additions and 258 deletions
  1. +8
    -5
      fastNLP/core/collators/collator.py
  2. +0
    -253
      fastNLP/core/collators/new_collator.py

+ 8
- 5
fastNLP/core/collators/collator.py View File

@@ -20,7 +20,7 @@ SUPPORTED_BACKENDS = ['torch', 'jittor', 'paddle', 'numpy', 'raw', 'auto', None]
CHECK_BACKEND = ['torch', 'jittor', 'paddle'] # backend 为 auto 时 检查是否是这些 backend CHECK_BACKEND = ['torch', 'jittor', 'paddle'] # backend 为 auto 时 检查是否是这些 backend




def _get_backend():
def _get_backend() -> str:
""" """
当 Collator 的 backend 为 None 的时候如何,通过这个函数自动判定其 backend 。判断方法主要为以下两个: 当 Collator 的 backend 为 None 的时候如何,通过这个函数自动判定其 backend 。判断方法主要为以下两个:
(1)尝试通过向上寻找当前 collator 的 callee 对象,根据 callee 对象寻找。然后使用 '/site-packages/{backend}' 来寻找是否是 (1)尝试通过向上寻找当前 collator 的 callee 对象,根据 callee 对象寻找。然后使用 '/site-packages/{backend}' 来寻找是否是
@@ -61,7 +61,7 @@ def _get_backend():
else: else:
break break
if len(catch_backend): if len(catch_backend):
logger.debug(f"Find a file named:{catch_backend[1]} from stack contain backend:{catch_backend[0]}.")
logger.debug(f"Find a file named:{catch_backend[1]} from stack contains backend:{catch_backend[0]}.")
return catch_backend[0] return catch_backend[0]


# 方式 (2) # 方式 (2)
@@ -70,7 +70,7 @@ def _get_backend():
if catch_backend: if catch_backend:
break break
if len(catch_backend): if len(catch_backend):
logger.debug(f"Find a file named:{catch_backend[1]} from sys.modules contain backend:{catch_backend[0]}.")
logger.debug(f"Find a file named:{catch_backend[1]} from sys.modules contains backend:{catch_backend[0]}.")
return catch_backend[0] return catch_backend[0]


return 'numpy' return 'numpy'
@@ -84,7 +84,7 @@ class Collator:
时候自动根据设置以及数据情况,为每个 field 获取一个 padder ,在之后的每次调用中,都将使用对应的 Padder 给对应的 field 。 时候自动根据设置以及数据情况,为每个 field 获取一个 padder ,在之后的每次调用中,都将使用对应的 Padder 给对应的 field 。


:param backend: 对于可以 pad 的 field,使用哪种 tensor,支持 ['torch','jittor','paddle','numpy','raw', auto, None]。 :param backend: 对于可以 pad 的 field,使用哪种 tensor,支持 ['torch','jittor','paddle','numpy','raw', auto, None]。
若为 'auto' ,则在进行 pad 的时候会根据调用的环境决定其 backend 。该参数对本身就不能进行 pad 的数据没用影响,不能 pad
若为 'auto' ,则在进行 pad 的时候会根据调用的环境决定其 backend 。该参数对不能进行 pad 的数据没用影响,不能 pad
的数据返回一定是 list 。 的数据返回一定是 list 。
""" """
self.unpack_batch_func = None self.unpack_batch_func = None
@@ -148,15 +148,18 @@ class Collator:
for key in unpack_batch.keys(): for key in unpack_batch.keys():
if key not in self.input_fields and key not in self.ignore_fields: if key not in self.input_fields and key not in self.ignore_fields:
self.input_fields[key] = {'pad_val': 0, 'dtype': None, 'backend': self.backend} self.input_fields[key] = {'pad_val': 0, 'dtype': None, 'backend': self.backend}
elif key in self.input_fields and self.input_fields[key]['backend'] == 'auto':
self.input_fields[key]['backend'] = self.backend


for field_name, setting in self.input_fields.items(): for field_name, setting in self.input_fields.items():
pad_fn = setting.get('pad_fn', None) pad_fn = setting.get('pad_fn', None)
if callable(pad_fn): if callable(pad_fn):
padder = pad_fn padder = pad_fn
else: else:
backend = self.backend if setting['backend'] == 'auto' else setting['backend']
batch_field = unpack_batch.get(field_name) batch_field = unpack_batch.get(field_name)
padder = get_padder(batch_field=batch_field, pad_val=setting['pad_val'], padder = get_padder(batch_field=batch_field, pad_val=setting['pad_val'],
dtype=setting['dtype'], backend=setting['backend'],
dtype=setting['dtype'], backend=backend,
field_name=field_name) field_name=field_name)
self.padders[field_name] = padder self.padders[field_name] = padder
if self.batch_data_type == 'l': if self.batch_data_type == 'l':


+ 0
- 253
fastNLP/core/collators/new_collator.py View File

@@ -1,253 +0,0 @@
from typing import List, Union, Dict, Callable, Sequence, Mapping
import os
import sys
import inspect

from fastNLP.core.log import logger
from .padders.get_padder import get_padder

import re

from .utils import unpack_batch_mapping, unpack_batch_nested_mapping, pack_batch_nested_mapping, unpack_batch_sequence, \
pack_batch_sequence

sequence_idx_str = re.compile(r'^_\d+$') # 形如_0, _1
SUPPORTED_BACKENDS = ['torch', 'jittor', 'paddle', 'numpy', 'raw', 'auto', None]
CHECK_BACKEND = ['torch', 'jittor', 'paddle'] # backend 为 auto 时 检查是否是这些 backend


def _get_backend() -> str:
"""
当 Collator 的 backend 为 None 的时候如何,通过这个函数自动判定其 backend 。判断方法主要为以下两个:
(1)尝试通过向上寻找当前 collator 的 callee 对象,根据 callee 对象寻找。然后使用 '/site-packages/{backend}' 来寻找是否是
某个 backend 的 dataloader 。
(2)如果方式(1)没找,则通过分析 sys.modules 中的内容进行寻找。

如果都没有找到则返回 numpy 。
:return:
"""
def _check_module(module):
"""
检查该 module 是否含有 某个 backend 的特征

:param module: module 对象
:return:
"""
catch_backend = []
try:
file = module.__file__
for backend in CHECK_BACKEND:
if f'{os.sep}site-packages{os.sep}{backend}' in file:
catch_backend = [backend, file]
except:
pass
return catch_backend

currentframe = inspect.currentframe()
# 方式(1)
catch_backend = []
for i in range(100):
currentframe = currentframe.f_back
if currentframe is not None:
module = inspect.getmodule(currentframe)
if module is not None:
catch_backend = _check_module(module)
if len(catch_backend): # 主要捕获到一个就结束吧
break
else:
break
if len(catch_backend):
logger.debug(f"Find a file named:{catch_backend[1]} from stack contains backend:{catch_backend[0]}.")
return catch_backend[0]

# 方式 (2)
for key, module in sys.modules.items():
catch_backend = _check_module(module)
if catch_backend:
break
if len(catch_backend):
logger.debug(f"Find a file named:{catch_backend[1]} from sys.modules contains backend:{catch_backend[0]}.")
return catch_backend[0]

return 'numpy'


class Collator:
def __init__(self, backend='auto'):
"""
用于 pad 数据的对象。会自动将所有能够 pad (由 fastNLP 根据数据判定能否 pad )的数据都进行 pad 操作,默认 pad 的值为 0。
可使用 set_pad() 函数调整。如果有些 field 不想输出,可以使用 set_ignore() 函数进行设置。Collator 在第一次进行 pad 的
时候自动根据设置以及数据情况,为每个 field 获取一个 padder ,在之后的每次调用中,都将使用对应的 Padder 给对应的 field 。

:param backend: 对于可以 pad 的 field,使用哪种 tensor,支持 ['torch','jittor','paddle','numpy','raw', auto, None]。
若为 'auto' ,则在进行 pad 的时候会根据调用的环境决定其 backend 。该参数对不能进行 pad 的数据没用影响,不能 pad
的数据返回一定是 list 。
"""
self.unpack_batch_func = None
self.pack_batch_func = None
self.ignore_fields = set()
self.padders = {}
self.input_fields = {}
self.batch_data_type = None # 只能是 d ,s ,l 三种,分别对应输入的batch的每个sample为 dict, single,list。
self.set_backend(backend)

def __call__(self, batch)->Union[List, Dict]:
"""
batch可能存在三种可能性
List[Dict], List[List], List[Sample]

第一步:使用 unpack_batch_func 将相同 field 的内容打包到一个 list 中。
第二步:使用每个 field 各自的 padder 进行 pad 。
第三步:根据 batch 中每个 sample 的类型,返回也保证为该类型。

第一次调用会根据当前 batch 数据决定使用哪个 unpack_batch_func ,这个函数的作用是把不同 sample 的同一个 field 的放入到一个
list 中;同时也会决定 pack_batch_func,这个函数的作用是在返回 pad 好的 batch 之前,将 batch 恢复为 输入时一个 sample
的类别。
第一次调用会根据当前 field 决定对应的 Padder 。

"""
if self.unpack_batch_func is None:
# 决定使用哪个unpack_batch_func,让它都 return 回 dict 类型
if self.batch_data_type is None:
if isinstance(batch[0], Mapping):
self.batch_data_type = 'd'
elif isinstance(batch[0], Sequence): # 这里存在误判的风险
self.batch_data_type = 'l'
else:
self.batch_data_type = 's'
logger.debug(f"Since batch[0] has type:{type(batch[0])}, so the batch_data_type "
f"is `{self.batch_data_type}`.")
if self.batch_data_type == 's':
self.unpack_batch_func = lambda batch, ignore_fields: {'_single': batch} # 不需要做任何调整
self.pack_batch_func = lambda x: x['_single']
elif self.batch_data_type == 'l':
self.unpack_batch_func = unpack_batch_sequence
self.pack_batch_func = pack_batch_sequence
elif self.batch_data_type == 'd':
if any([isinstance(v, Mapping) for v in batch[0].values()]): # 可能存在 nested 的dict。{'a': {'b': xx}}->{('a', 'b'): value}
self.unpack_batch_func = unpack_batch_nested_mapping
self.pack_batch_func = pack_batch_nested_mapping
else:
self.unpack_batch_func = unpack_batch_mapping
self.pack_batch_func = lambda x:x

if self.unpack_batch_func is unpack_batch_nested_mapping: # 比较特殊,需要防止继续往下延伸
unpack_batch: Dict = self.unpack_batch_func(batch, self.ignore_fields, set(self.input_fields.keys()))
else:
unpack_batch:Dict = self.unpack_batch_func(batch, self.ignore_fields) # 将各自 field 组成 batch 形式。

pad_batch = {}
if len(self.padders)==0: # 第一次运行,准备 padder
if self.backend == 'auto': # 如果 backend 为 auto ,则尝试通过调用栈等自动获取 backend 。
self.backend = _get_backend()

for key in unpack_batch.keys():
if key not in self.input_fields and key not in self.ignore_fields:
self.input_fields[key] = {'pad_val': 0, 'dtype': None, 'backend': self.backend}
elif key in self.input_fields and self.input_fields[key]['backend'] == 'auto':
self.input_fields[key]['backend'] = self.backend

for field_name, setting in self.input_fields.items():
pad_fn = setting.get('pad_fn', None)
if callable(pad_fn):
padder = pad_fn
else:
backend = self.backend if setting['backend'] == 'auto' else setting['backend']
batch_field = unpack_batch.get(field_name)
padder = get_padder(batch_field=batch_field, pad_val=setting['pad_val'],
dtype=setting['dtype'], backend=backend,
field_name=field_name)
self.padders[field_name] = padder
if self.batch_data_type == 'l':
self.padders = dict(sorted(self.padders.items(), key=lambda x:int(x[0][1:]))) # sort, 这样 _0, _1 能够保持顺序

for key, padder in self.padders.items():
batch = unpack_batch.get(key)
pad_batch[key] = padder(batch)

return self.pack_batch_func(pad_batch) # 根据情况恢复成与输入一致的类型

def set_pad(self, field_name:Union[str, tuple], pad_val:Union[int, float, None]=0, dtype=None, backend='auto',
pad_fn:Callable=None) -> "Collator":
"""
如果需要对某个 field 的内容进行特殊的调整,请使用这个函数。

:param field_name: 需要调整的 field 的名称。如果 Dataset 的 __getitem__ 方法返回的是 dict 类型的,则可以直接使用对应的
field 的 key 来表示,如果是 nested 的 dict,可以使用元组表示多层次的 key,例如 {'a': {'b': 1}} 中的使用 ('a', 'b');
如果 __getitem__ 返回的是 Sequence 类型的,则可以使用 '_0', '_1' 表示序列中第 0 或 1 个元素。如果该 field 在数据中没
有找到,则报错;如果 __getitem__ 返回的是就是整体内容,请使用 "_single" 。
:param pad_val: 这个 field 的默认 pad 值。如果设置为 None,则表示该 field 不需要 pad , fastNLP 默认只会对可以 pad 的
field 进行 pad,所以如果对应 field 本身就不是可以 pad 的形式,可以不需要主动设置为 None 。如果 backend 为 None ,该值
无意义。
:param dtype: 对于需要 pad 的 field ,该 field 的数据 dtype 应该是什么。
:param backend: 可选['raw', 'numpy', 'torch', 'paddle', 'jittor', 'auto'],分别代表,输出为 list, numpy.ndarray,
torch.Tensor, paddle.Tensor, jittor.Var 类型。若 pad_val 为 None ,该值无意义 。
:param pad_fn: 指定当前 field 的 pad 函数,传入该函数则 pad_val, dtype, backend 等参数失效。pad_fn 的输入为当前 field 的
batch 形式。 Collator 将自动 unbatch 数据,然后将各个 field 组成各自的 batch 。pad_func 的输入即为 field 的 batch
形式,输出将被直接作为结果输出。
:return: 返回 Collator 自身
"""
self.padders.clear() # 重新生成

if self.batch_data_type is not None:
if self.batch_data_type == 's':
logger.debug("Set as single field mode.")
self.input_fields.clear()
elif self.batch_data_type == 'd':
assert sequence_idx_str.match(field_name) is None, f"Field name:{field_name} will be recognized as list " \
f"index, but other field is set as dict mode."
elif self.batch_data_type == 'l':
assert sequence_idx_str.match(field_name) is not None, f"Other field is set as list mode. But the new " \
f"field name is {field_name}."

if field_name == '_single':
self.batch_data_type = 's'
elif isinstance(field_name, str) and sequence_idx_str.match(field_name):
self.batch_data_type = 'l'
else:
self.batch_data_type = 'd'

if field_name in self.ignore_fields:
logger.warning(f"Field:{field_name} has been set as ignored before. It will not be ignored afterwards.")
if backend is None:
backend = self.backend
else:
assert backend in SUPPORTED_BACKENDS

self.input_fields[field_name] = {'pad_val': pad_val, 'dtype': dtype, 'backend': backend, 'pad_fn': pad_fn}

return self

def set_backend(self, backend:str):
"""
设置可以 pad 的 field 默认 pad 为什么类型的 tensor

:param backend: 对于可以 pad 的 field,使用哪种 tensor,支持 ['torch','jittor','paddle','numpy','raw', 'auto', None],
若为 auto ,则在进行 pad 的时候会根据调用的环境决定其 backend 。
:return:
"""
assert backend in SUPPORTED_BACKENDS
self.padders.clear()
self.backend = backend

def set_ignore(self, *field_names) -> "Collator":
"""
如果有的内容不希望输出,可以在此处进行设置,被设置的 field 将在 batch 的输出中被忽略。
Ex::
collator.set_ignore('field1', 'field2')

:param field_names: 需要忽略的 field 的名称。如果 Dataset 的 __getitem__ 方法返回的是 dict 类型的,则可以直接使用对应的
field 的 key 来表示,如果是 nested 的 dict,可以使用元组来表示,例如 {'a': {'b': 1}} 中的使用 ('a', 'b'); 如果
__getitem__ 返回的是 Sequence 类型的,则可以使用 '_0', '_1' 表示序列中第 0 或 1 个元素。
:return: 返回 Collator 自身
"""
for field_name in field_names:
if field_name in self.input_fields:
self.input_fields.pop(field_name)
logger.warning(f"Field:{field_name} has been set as input before. It will be ignored afterwards.")
self.padders.pop(field_name, None) # 如果由的话,将它的 padder 扔掉。
self.ignore_fields.add(field_name)

return self



Loading…
Cancel
Save